MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Natrinema pellirubrum DSM 15624 plasmid pNATPE01

Total Repeats: 6268

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019967	AGA	2	6	8	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_019967	CGA	2	6	34	39	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_019967	GGT	2	6	53	58	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_019967	AACC	2	8	74	81	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_019967	GAT	2	6	84	89	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_019967	AGG	2	6	93	98	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_019967	AC	3	6	167	172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_019967	AGT	2	6	214	219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_019967	AG	3	6	264	269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_019967	ACA	2	6	290	295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_019967	CCA	2	6	296	301	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_019967	ACT	2	6	351	356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_019967	GTG	2	6	381	386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_019967	TA	3	6	427	432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_019967	CAA	2	6	490	495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
16	NC_019967	GAG	2	6	533	538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
17	NC_019967	GAG	2	6	545	550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
18	NC_019967	GAG	2	6	554	559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
19	NC_019967	CGT	2	6	580	585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
20	NC_019967	AAC	2	6	602	607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
21	NC_019967	CCG	2	6	642	647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593319
22	NC_019967	CTG	2	6	786	791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
23	NC_019967	CAA	2	6	821	826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
24	NC_019967	AAC	3	9	953	961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
25	NC_019967	CTCGA	2	10	962	971	20 %	20 %	20 %	40 %	433593319
26	NC_019967	AC	3	6	1041	1046	50 %	0 %	0 %	50 %	433593319
27	NC_019967	ATG	2	6	1077	1082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593319
28	NC_019967	AATCGC	2	12	1120	1131	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	433593319
29	NC_019967	GT	3	6	1152	1157	0 %	50 %	50 %	0 %	433593319
30	NC_019967	GCT	2	6	1178	1183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593319
31	NC_019967	CCT	2	6	1216	1221	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593319
32	NC_019967	GCA	2	6	1286	1291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593319
33	NC_019967	GGA	2	6	1318	1323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593319
34	NC_019967	GAC	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593319
35	NC_019967	GCC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593319
36	NC_019967	CTCG	2	8	1462	1469	0 %	25 %	25 %	50 %	433593319
37	NC_019967	ATC	2	6	1488	1493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593319
38	NC_019967	ACT	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593319
39	NC_019967	CGTTC	2	10	1579	1588	0 %	40 %	20 %	40 %	433593319
40	NC_019967	AAC	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593319
41	NC_019967	AC	3	6	1682	1687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_019967	GCT	2	6	1707	1712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_019967	GTG	2	6	1744	1749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_019967	GTG	2	6	1803	1808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_019967	TG	3	6	1807	1812	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_019967	GAT	2	6	1820	1825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_019967	TCG	2	6	1958	1963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_019967	A	6	6	1964	1969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_019967	GAT	2	6	1971	1976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_019967	CTG	2	6	2226	2231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
51	NC_019967	CTC	2	6	2244	2249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593320
52	NC_019967	TCG	2	6	2260	2265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
53	NC_019967	TC	3	6	2414	2419	0 %	50 %	0 %	50 %	433593320
54	NC_019967	AGC	2	6	2453	2458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593320
55	NC_019967	GTTC	2	8	2483	2490	0 %	50 %	25 %	25 %	433593320
56	NC_019967	CTG	2	6	2577	2582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
57	NC_019967	ACG	2	6	2592	2597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593320
58	NC_019967	GTT	2	6	2670	2675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	433593320
59	NC_019967	GTGG	2	8	2839	2846	0 %	25 %	75 %	0 %	433593320
60	NC_019967	GGA	2	6	2864	2869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	433593320
61	NC_019967	CAC	2	6	2990	2995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593320
62	NC_019967	TCG	2	6	3079	3084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
63	NC_019967	GGCTTT	2	12	3111	3122	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	433593320
64	NC_019967	CGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593320
65	NC_019967	CAC	2	6	3157	3162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	433593320
66	NC_019967	TC	3	6	3203	3208	0 %	50 %	0 %	50 %	433593320
67	NC_019967	AG	3	6	3211	3216	50 %	0 %	50 %	0 %	433593320
68	NC_019967	TGA	2	6	3245	3250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593320
69	NC_019967	CGG	2	6	3251	3256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593320
70	NC_019967	CGG	2	6	3259	3264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593320
71	NC_019967	GTC	2	6	3316	3321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_019967	TCC	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_019967	TCG	2	6	3479	3484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
74	NC_019967	CTCACT	2	12	3502	3513	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	433593321
75	NC_019967	GCT	2	6	3522	3527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
76	NC_019967	CGT	2	6	3603	3608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
77	NC_019967	TCC	3	9	3614	3622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593321
78	NC_019967	CGAT	2	8	3686	3693	25 %	25 %	25 %	25 %	433593321
79	NC_019967	CCT	2	6	3720	3725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593321
80	NC_019967	CGT	2	6	3726	3731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
81	NC_019967	ATC	2	6	3844	3849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	433593321
82	NC_019967	CAG	2	6	3871	3876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593321
83	NC_019967	CAG	2	6	3952	3957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593321
84	NC_019967	CTGT	2	8	3995	4002	0 %	50 %	25 %	25 %	433593321
85	NC_019967	TCG	2	6	4016	4021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593321
86	NC_019967	GT	3	6	4030	4035	0 %	50 %	50 %	0 %	433593321
87	NC_019967	GAT	3	9	4243	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	433593321
88	NC_019967	CTT	2	6	4335	4340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593321
89	NC_019967	TCT	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_019967	TGAC	2	8	4432	4439	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_019967	TTGA	2	8	4674	4681	25 %	50 %	25 %	0 %	433593322
92	NC_019967	TCG	2	6	4699	4704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
93	NC_019967	CAGC	2	8	4733	4740	25 %	0 %	25 %	50 %	433593322
94	NC_019967	GCG	2	6	4810	4815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593322
95	NC_019967	TCG	3	9	4831	4839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
96	NC_019967	GTC	2	6	4905	4910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
97	NC_019967	GGC	2	6	4971	4976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593322
98	NC_019967	CGCT	2	8	5064	5071	0 %	25 %	25 %	50 %	433593322
99	NC_019967	GTC	2	6	5085	5090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593322
100	NC_019967	CGGT	2	8	5116	5123	0 %	25 %	50 %	25 %	433593322
101	NC_019967	CAGCG	2	10	5136	5145	20 %	0 %	40 %	40 %	433593322
102	NC_019967	GTC	2	6	5173	5178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_019967	CTC	2	6	5201	5206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_019967	TCG	2	6	5256	5261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_019967	TGA	2	6	5263	5268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_019967	GTT	2	6	5284	5289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_019967	AGT	2	6	5326	5331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_019967	CTA	2	6	5337	5342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_019967	GACG	2	8	5344	5351	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_019967	CGA	2	6	5440	5445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_019967	TGC	2	6	5530	5535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_019967	GCC	2	6	5545	5550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_019967	ACG	2	6	5588	5593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_019967	CGA	2	6	5599	5604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_019967	CTT	2	6	5645	5650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593323
116	NC_019967	GCG	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	433593323
117	NC_019967	AGCG	2	8	5680	5687	25 %	0 %	50 %	25 %	433593323
118	NC_019967	TCG	2	6	5709	5714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
119	NC_019967	GACG	2	8	5799	5806	25 %	0 %	50 %	25 %	433593323
120	NC_019967	GTG	2	6	5807	5812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593323
121	NC_019967	GTGGGT	2	12	5821	5832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	433593323
122	NC_019967	GCT	2	6	5838	5843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
123	NC_019967	GGCT	2	8	5969	5976	0 %	25 %	50 %	25 %	433593323
124	NC_019967	CGT	2	6	5983	5988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593323
125	NC_019967	CCT	2	6	6088	6093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	433593323
126	NC_019967	GCC	2	6	6117	6122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593323
127	NC_019967	AAC	2	6	6180	6185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	433593323
128	NC_019967	TC	3	6	6208	6213	0 %	50 %	0 %	50 %	433593323
129	NC_019967	CTT	2	6	6262	6267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593323
130	NC_019967	CA	3	6	6281	6286	50 %	0 %	0 %	50 %	433593323
131	NC_019967	GC	4	8	6338	6345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_019967	GGAG	2	8	6353	6360	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_019967	GGTG	2	8	6373	6380	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_019967	GGT	2	6	6403	6408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_019967	A	6	6	6415	6420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_019967	TTC	3	9	6455	6463	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	433593324
137	NC_019967	GTC	2	6	6479	6484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593324
138	NC_019967	CGA	2	6	6511	6516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
139	NC_019967	CG	3	6	6531	6536	0 %	0 %	50 %	50 %	433593324
140	NC_019967	CGC	3	9	6569	6577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
141	NC_019967	AGC	2	6	6612	6617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	433593324
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143	NC_019967	CGC	2	6	6641	6646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	433593324
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169	NC_019967	CGG	2	6	7667	7672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_019967	GAT	2	6	7762	7767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_019967	CG	3	6	7802	7807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_019967	CGC	2	6	7813	7818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_019967	TCG	2	6	7838	7843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
174	NC_019967	TGG	2	6	7883	7888	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_019967	CGA	2	6	7899	7904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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178	NC_019967	CTG	2	6	8040	8045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_019967	TCGC	2	8	8049	8056	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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182	NC_019967	GTC	2	6	8101	8106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_019967	TA	3	6	8199	8204	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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263	NC_019967	CAA	2	6	10968	10973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
264	NC_019967	TCT	2	6	11004	11009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
265	NC_019967	GA	3	6	11033	11038	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
266	NC_019967	GCG	2	6	11059	11064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_019967	CTA	2	6	11068	11073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_019967	GAA	2	6	11086	11091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_019967	AG	3	6	11102	11107	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
270	NC_019967	TCA	2	6	11120	11125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_019967	TCG	2	6	11195	11200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593329
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273	NC_019967	TCG	2	6	11270	11275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593329
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281	NC_019967	GAT	2	6	11876	11881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019967	CCA	2	6	11995	12000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
283	NC_019967	GAAT	2	8	12166	12173	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
284	NC_019967	CAG	2	6	12285	12290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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399	NC_019967	CGT	2	6	18121	18126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593336
400	NC_019967	GAAC	2	8	18213	18220	50 %	0 %	25 %	25 %	433593336
401	NC_019967	CG	3	6	18288	18293	0 %	0 %	50 %	50 %	433593336
402	NC_019967	CGT	2	6	18321	18326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	433593336
403	NC_019967	CGCT	2	8	18369	18376	0 %	25 %	25 %	50 %	433593336
404	NC_019967	TCGA	2	8	18389	18396	25 %	25 %	25 %	25 %	433593336
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421	NC_019967	TGGG	2	8	19042	19049	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
422	NC_019967	GCG	2	6	19050	19055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
423	NC_019967	A	6	6	19080	19085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_019967	CG	3	6	20097	20102	0 %	0 %	50 %	50 %	433593338
454	NC_019967	CTCG	2	8	20105	20112	0 %	25 %	25 %	50 %	433593338
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